اختلاف نظرها باعث عدم رسمیت و به نصاب نرسیدن جلسات مجمع روحانیون مبارزه شده است.
به گزارش رهوا روزنامه رسالت نوشت :شنیده های موثق از عناصر نزدیك به مجمع روحانیون مبارز حاكی است اختلاف نظر و بروز دو طیف مختلف در درون مجمع روحانیون مبارز در سال جاری تشدید شده و به همین خاطر ماه هاست تشكیل جلسات مجمع روحانیون به تعویق افتاده و تنها یك بار در سال89 این مجمع توانسته جلسه رسمی باحضور نصف به علاوه یك اعضا را داشته باشد. اخبار رسیده در این زمینه حاكی است كه به علت به نصاب نرسیدن تعداد اعضای مجمع برای تشكیل جلسه، برخی اعضا با تشكیل جلسات غیر رسمی در منازل برخی از اعضا از جمله خاتمی به مشورت و رایزنی می پردازند.
دسته بندی برخی اعضای مجمع به طرفداران موسوی و یا كروبی، اختلاف نظر درباره مواضع مجمع در قبال حوادث پس از انتخابات، تمایل بعضی از اعضا به سكوت در برابر رفتارهای ساختارشكنانه میرحسین و كروبی و طرفداری برخی اعضای افراطی مجمع به حمایت از میر حسین و كروبی و طرفداری برخی اعضای افراطی مجمع به حمایت از میرحسین و طرفداری تعداد اندكی به جذب كروبی و... از جمله دلایلی است كه باعث عدم تشكیل جلسات مجمع روحانیون مبارز می باشد. طبق شنیده های موثق در یكی از جلسات غیر رسمی كه در منزل یكی از اعضا تشكیل شده بود بحث ابطحی و اعترافات او در دادگاه و ضرباتی كه از این طریق به حیثیت جریان اصلاحات و خاتمی وارد شده مورد بررسی قرار گرفت كه در این جلسه مجید انصاری و موسوی لاری خواستار برخورد با ابطحی و اخراج او از مجمع شدند اما ابطحی در پی اطلاع از مواضع منفی برخی اعضا نسبت به خود تقاضا كرده جلسه ای برگزار شود تا وی توضیحات خود را ارائه كند اما چند ماهی است كه جلسه ای برگزار نشده است. نظر به اینكه مجمع روحانیون اخبار مربوط به خود را به مصلحت نمی داند سریع تكذیب می كند لذا در صورت تكذیب این خبر، اطلاعات بیشتری منتشر خواهد شد.